南v所在蓝子鱼染色体基因组研究斚w取得新进?/h3>
q日Q中国水产科学研I南v水研究所院卵Ş鲳a遗传育种创新团队和深qvL技术与品种开发创新团队在蓝子鱼染色体基因l研I方面取得新q展。相关研I成果分别以《Chromosome-scale genomes of ecologically and economically important rabbitfish Siganus guttatus and Siganus oramin》和?Chromosome-level genome assembly and annotation of the White-spotted spinefoot Siganus canaliculatus》ؓ题发表在国际基因l学领域权威期刊《Genomics》(JCR二区QIF=3.4Q冼霖助理研I员和黄林助理研究员ؓW一作者,张殿昌研I员与李启业副研I员为通讯作者)、国际科学数据共享领域知名期刊?/span>Scientific Data》(JCR一区,IF=5.8Q黄林助理研究员和冼霖助理研究员ؓW一作者,张殿昌研I员与李潮副教授为通讯作者)?/span>
本研I综合运用了多种l学技术,成功构徏了黄斑蓝子鱼和点斑蓝子鱼的染色体水^基因l图谱。采用Pacbio长读长测序、Hi-C染色质构象捕h序、Iso-seq和RNA-seq{技术,寚w斑蓝子鱼和点斑蓝子鱼q行了基因组序和组装,获得的基因组h较高的完整性和q箋性,其中黄斑蓝子鱼基因组大小?47.39 MbQ点斑蓝子鱼基因l大ؓ642.4 MbQ结合从头预、同源比对和转录l辅助等ҎQ对基因l进行了全面的注释,包括重复序列注释、非~码RNA预测和蛋白质~码基因预测Q对两种蓝子鱼的基因l进行了比较基因l分析,q与其他鱼类物种q行了进化关pd析,以研I其食性和栖息?span style="text-indent: 2em;">的进化适应机制?/span>

本研Iơ提供了高质量的蓝子鱼染色体水^基因l资源,子鱼的遗传育U、种质资源保护和相关基础生物学研I奠定了重要基础。获取的基因l信息将加速蓝子鱼的分子标记开发和基因l选择育种技术的应用Q从而ؓ培育优良品种助力。基因组数据可用于评估野生种的遗传多样性,指导保护区的U学规划Qؓ蓝子鱼的可持l管理提供理论支撑。基因组资源促q对蓝子鱼遗传分化机制、适应性进化和重要l济性状分子机制的深入研I。这一成果为后l种遗传学、保护基因组学和分子育种研究提供了关键资源,有望推动蓝子鱼养D业的可持箋发展和相关科学研I的q步?/p>
本研I获得南锋专农业农村部重大财政专项、广东省乡村振兴战略专项资金U业振兴目资金Q?022SBH00002)、深圛_U技计划知识创新基础研究目(JCYJ20170817103922921)、亚z合作资?中国与南周边国家现代渔业合作、国家自然科学基金(32300366Q、中国水产科学研I中央U公益性科研院所基本U研业务费专资金资助(NO.2023TD93Q等目资助?/p>
全文获取链接Q?/p>
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754325000230
https://www.nature.com/articles/s41597-025-04844-w
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q日Q中国水产科学研I南v水研究所院卵Ş鲳a遗传育种创新团队和深qvL技术与品种开发创新团队在蓝子鱼染色体基因l研I方面取得新q展。相关研I成果分别以《Chromosome-scale genomes of ecologically and economically important rabbitfish Siganus guttatus and Siganus oramin》和?Chromosome-level genome assembly and annotation of the White-spotted spinefoot Siganus canaliculatus》ؓ题发表在国际基因l学领域权威期刊《Genomics》(JCR二区QIF=3.4Q冼霖助理研I员和黄林助理研究员ؓW一作者,张殿昌研I员与李启业副研I员为通讯作者)、国际科学数据共享领域知名期刊?/span>Scientific Data》(JCR一区,IF=5.8Q黄林助理研究员和冼霖助理研究员ؓW一作者,张殿昌研I员与李潮副教授为通讯作者)?/span>
本研I综合运用了多种l学技术,成功构徏了黄斑蓝子鱼和点斑蓝子鱼的染色体水^基因l图谱。采用Pacbio长读长测序、Hi-C染色质构象捕h序、Iso-seq和RNA-seq{技术,寚w斑蓝子鱼和点斑蓝子鱼q行了基因组序和组装,获得的基因组h较高的完整性和q箋性,其中黄斑蓝子鱼基因组大小?47.39 MbQ点斑蓝子鱼基因l大ؓ642.4 MbQ结合从头预、同源比对和转录l辅助等ҎQ对基因l进行了全面的注释,包括重复序列注释、非~码RNA预测和蛋白质~码基因预测Q对两种蓝子鱼的基因l进行了比较基因l分析,q与其他鱼类物种q行了进化关pd析,以研I其食性和栖息?span style="text-indent: 2em;">的进化适应机制?/span>
本研Iơ提供了高质量的蓝子鱼染色体水^基因l资源,子鱼的遗传育U、种质资源保护和相关基础生物学研I奠定了重要基础。获取的基因l信息将加速蓝子鱼的分子标记开发和基因l选择育种技术的应用Q从而ؓ培育优良品种助力。基因组数据可用于评估野生种的遗传多样性,指导保护区的U学规划Qؓ蓝子鱼的可持l管理提供理论支撑。基因组资源促q对蓝子鱼遗传分化机制、适应性进化和重要l济性状分子机制的深入研I。这一成果为后l种遗传学、保护基因组学和分子育种研究提供了关键资源,有望推动蓝子鱼养D业的可持箋发展和相关科学研I的q步?/p>
本研I获得南锋专农业农村部重大财政专项、广东省乡村振兴战略专项资金U业振兴目资金Q?022SBH00002)、深圛_U技计划知识创新基础研究目(JCYJ20170817103922921)、亚z合作资?中国与南周边国家现代渔业合作、国家自然科学基金(32300366Q、中国水产科学研I中央U公益性科研院所基本U研业务费专资金资助(NO.2023TD93Q等目资助?/p>
全文获取链接Q?/p>
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754325000230
https://www.nature.com/articles/s41597-025-04844-w