南v所Z环境DNA技术解析河口鱼cȝ落时I差异研I取得新q展
研究区域珠江口采样位点示意图
q日Q中国水产科学研I南v水研究所南v渔业资源调查与评估团队和南v珍稀Ȓ危动物保护团队在利用环境DNAQeDNAQ技术解析河口鱼cdh和鱼类落时空差异斚w取得新进展。该研究成果论文以?span style="font-family: "times new roman";">Comparison of environmental DNA metabarcoding and bottom trawling for detecting seasonal fish communities and habitat preference in a highly disturbed estuary”ؓ题发表在国际生态学领域期刊Ecological IndicatorsQJCR Q1Q上。蒋佩文为第一作者,陈作志与李敏为通讯作者?/p>
沛_鱼类是河口生态系l的重要l成部分Q在人类zd日益加剧的背景下Q鱼cdh和落l构的监越来越凸显光要性。然而河口v域水p、航U较多和水体浊{,现有的一些调查手D常常受C些限制。研I团队在之前建立的河口v域eDNA富集ҎQDOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2021.331QDOI: 10.12131/20210304Q和珠江沛_本底鱼类eDNA宏条形码数据库(DOI: 10.12131/20210210Q的基础上,利用eDNA宏条形码研究了珠江口伶仃z的鱼类物种l成、群落时I差异以及与环境因子的关p,q与底拖|调查方法进行了比较?/p>
该研I于U季和春季在珠江沛_?0个监点同时q行了底拖网捕捞、水体采样和环境因子量。水体样本过滤后提取eDNAQ利用MiFish-U/E引物q行U粒?2SrRNA基因Q约172bpQ的扩增、徏库、测序和OTU注释Q通过数据库的比对获得鱼类物种l成。主要结果有Q?. eDNAҎ在每个采L均比底拖|明显检出更多的物种QM上eDNA共检?14U鱼c(底拖|?0U)Q同时eDNA种cȝ相对丰度与鱼cȝU丰?生物量之间存在显著相x。鱼cȝ态习性分析表明,eDNA可以出因传统渔网|目大小限制而漏的小型鱼c,佉Kcȝ落生态特征更加完_2. 两种Ҏ均检到鱼类U类的季节更替,x季和U季鱼类落存在显著差异QeDNAҎ到的显著性比底拖|更强?. eDNA与底拖网一样均揭示了鱼cȝ落组成差异随着地理距离的增加而显著增加。上q结果表明在沛_生态系l中Q特别是传统调查Ҏ存在困难的情况下QeDNA宏条形码可作ZU重要的补充手段甚至替代Ҏ应用于鱼cȝ落的季节性变化和I间分布变化的监,提升评估沛_生态系l中鱼类落l构的能力,在渔业研I域和生态环境监领域具有很好的应用前景?/p>
该研I得到国安点研发计划(2018YFD0900906Q、中国水产科学研I中央U公益性科研院所基本U研业务费(2020TD05?021SD01?021SD18Q等目资助?/p>
论文链接Q?a >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1470160X22012274
ZeDNA和底拖网的鱼cȝU组成对?/p>
eDNA和底拖网的物种数量、α多h和NMDS 排序