南v所构徏完成黄鳍鲷染色体水q_因组图谱
q日Q中国水产科学研I南v水研究所遗传育种创新团队寚w鳍棘鲷基因组解析的研I取得重要进展,相关研究成果在国际知名期刊Genomics上在U发表,朱克诚副研究员ؓ论文W一作者,张殿昌研I员为通讯作者。该研究得到农业农村部胦政专V广东省实验室项目、中?东盟上合作基金{共同资助?/p>
黄鳍鲷是华南咸淡水区域主要L的鱼cM一Q典型河口鱼c,肉质l嫩Q味道鲜,深受消费者欢q。但是,长期以来Q黄鳍棘鲷野生苗U生长相对缓慢,亟待开展黄鳍棘L长快、抗病能力强的新品种选育Q绘刉鳍棘鲷基因组_图谱Q可为其重要l济性状的遗传解析和全基因组选择育种提供基础数据?/p>
张殿昌研I员团队利用W二、三代测序和Hi-C染色体构象捕h术,构徏了黄鳍棘h色体水^的基因组图谱Q其基因l大ؓ806MbQcontig N50和scaffold N50分别辑ֈ2.60 Mb?0.2 MbQ利用Hi-C技术成功将90.8%的组装序列挂载到24条染色体上,鉴定?9,631蛋白~码基因Q基因家族分析显CARRDC3 ?GSTA基因家族在广盐性的L鱼类中出C大量扩张Qؓ后箋研究L鱼类渗透压调节机制提供了重要参考?/p>
论文链接Q?a >https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.04.017?/p>
黄鳍鲷基因l序列图?/p>
黄鳍鲷ARRDC3基因家族信息
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