?!DOCTYPE html> 南v所完成卵Ş鲳a基因l染色体图谱l制-南v水研究所

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南v所完成卵Ş鲳a基因l染色体图谱l制

撰写旉Q?019-10-24 [来源Q南h产研I所 ]

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中国水U学研究院南h产研I所联合院生物技术研I中心,成功破译卵Ş鲳a基因l,l制完成卵Ş鲳a基因l染色体图谱Qؓ深度解析卵Ş鲳a重要l济性状的遗传基Q深入开展基因组选择育种和分子设计育U等工作奠定了基。该研究成果?0?2日正式在Scientific Data杂志QIF=5.9Q发表。全文链接:https://www.nature.com/articles/s41597-019-0238-8?/p>

卵Ş鲳a基因l染色体图谱l制研究论文以南h产研I所张殿昌研I员、郭梁助理研I员、郭华阳助理研究员、朱克诚副研I员为共同第一作者,张殿昌研I员和李炯棠研究员ؓ共同通讯作者。该研究先后获得国家h鱼类产业技术体pR国安点研发计划、中?东盟上合作基金{项目支持?/p>

卵Ş鲳a俗称金鲳Q具有生长快、肉质鲜、全E可摄食人工配合饲料、养D周期短和适合深水抗风网养D的特点Q是拓展p养D的重要品种之一Q目前是我国南、广东和q西深水抗风网养D的主要品种。随着其养D规模的不断扩大Q种质退化、病害频发等问题逐渐N?/p>

研究团队利用W二、三代测序和Hi-C染色体构象捕h术,构徏了卵形鲳Ҏ色体水^的基因组图谱Q研I揭C卵形鲳鲹基因组大小?55 MbQcontig N50和scaffold N50分别辑ֈ1.80 Mb?.05 MbQ利用Hi-C技术成功将99.4%的组装序列挂载到24条染色体上,染色体^均长度ؓ26.84 MbQ鉴定出21915蛋白~码基因。多U指标表明,该基因组图谱h高可靠性。比较基因组分析卵Ş鲳a基因l与q缘物种基因l具有高度共U性和保守性?/p>



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